global consortium for higher education and research for

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CONGRESO INTERNACIONAL DE BIOINFORMATICA
Y BIOLOGIA DE SISTEMAS.
OMICS integrativas: Medicina Molecular, Biodiversidad y
Medio Ambiente
Fechas: 28, 29 y 30 de Marzo 2012
Lugar: Hotel Barceló San José Palacio, San José, Costa Rica.
PROGRAMACION
Organizadora general: Ana Tamayo (EARTH).
Organizador científico: Allan Orozco (UCR/INB).
Organizadora ejecutiva: Marianela Castro (EARTH).
Miércoles 28 de marzo: Recepción y registro se realizará durante toda la mañana.
Salón AguaMarina
Mañana:
9:00 – 9:30 a.m.
Apertura inaugural del evento: Ana Cristina Tamayo MSc.
Universidad EARTH (Coordinadora general del evento). Dr.
Ricardo Boza. Director de Escuela de Medicina. Universidad de
Costa Rica. Viceministro de Ciencia y Tecnología. Keylor Rojas.
PhD.
9.30 –10.15 a.m.
Presentación en plenaria. Allan Orozco. Bioinformática y su
aplicación en la medicina molecular. General Manager: Instituto
Nacional de Bioinformática (INB); Centro Nacional de
investigaciones Oncológicas (CNIO)- España.
- Director de la Red Centroamericana de Bioinformática.
Manager node EMBNET (Red Mundial de Bioinformática)/ Costa
Rica-Laboratorio de Investigación en Bioinformática (BREL), Escuela
de Medicina, Universidad de Costa Rica (UCR).
10.15- 10:30 a.m.
Receso - café
10:30 – 11:15 a.m.
Presentación en plenaria. A Systems Biology approach of
sphingolipid pathway to assess cancer robustness and
heterogeneity. Rodrigo Mora. PhD (DKFZ, Germany). CIET.
Profesor de la Maestría en Bioinformática y Biología de Sistemas.
Universidad de Costa Rica.
11:15 – 12:00 m.d.
Presentación en plenaria. José Valverde. PhD. Modelación GRID
y simulación molecular cuántica. Director de computación
científica. Centro Nacional de Biotecnología (CNB), España.
Coordinador RED CYTED FREEBIT y Manager node EMBNET
(Red Mundial de Bioinformática)/ España.
12:00 – 1:00 p.m.
Almuerzo
Tarde:
1:00 – 1:45 p.m.
Presentación en plenaria. Microbial Diversity: the “Copernican”
Revolution of Biology. David Holmes. PhD. Director del Centro
de Bioinformática y Genómica. Santiago de Chile.
1:45 – 2:30 p.m.
Presentación en plenaria. Structure and mechanism of UDPgalactopyranose mutases from eukaryotic human pathogens.
Pablo Sobrado. PhD (Texas A &M University, EEUU). Virginia
Institute of Technology (Virginia Tech), Head Leader. Premio
Nacional de Tecnología de Costa Rica 2011. EEUU.
2:30 – 3:00 p.m.
Receso – café
3:00 – 3:45 p.m.
Presentación en plenaria. Bioinformática en STRI. Smithsonian
Tropical Research Institute (STRI, sede central: Washington,
EEUU). Steven Patton. PhD.
Director de Bioinformática.
Miembro de la Red Centroamericana de Bioinformática y
Biología computacional. Panamá.
3:45– 4:30 p.m.
Presentación en plenaria. Logical Analysis of Data and its
Application to Chronic Kidney Disease. Munevver Mine Subasi.
PhD. Florida Institute of Technology. EEUU.
4:30– 5:00 p.m.
Presentacion en plenaria (teleconferencia). Evolution of linear
motifs within the intrinsically disordered and globular
domains of the papillomavirus E7 oncoprotein.
A2B2C
(Asociación Argentina de Bioinformática y Biología
Computacional). Ignacio E. Sánchez. PhD.CONICET researcher
Co-director, Protein Physiology Lab. Universidad de Buenos Aires
(Argentina)
Jueves 29 de marzo: Roadhows and Project Meeting:
Congreso Nacional y Centroamericano de Bioinformática
Mañana:
Presentaciones por salas (2 salas), se realizarán mesas de
presentación por sala, cada sala trabajará uno de los subtemas del
evento: Medicina molecular, Biodiversidad y Medio ambiente:
Sala 1/Atlántico: BIODIVERSIDAD Y MEDIO AMBIENTE
Chairs: Ana Tamayo y Allan Orozco.
8:30 - 9:15 a.m.
Ponencia 1: La Bioinformática como instrumento para el
control de los vectores de la enfermedad de Chagas. Pamela
Pennington. PhD (Yale University, EEUU).
Departamento
Bioquímica y Microbiología/ Centro de Biotecnología, Directora.
Universidad del Valle.
Miembro de la Red Centroamericana de Bioinformática y Biología
computacional. Guatemala.
9:15 - 10:00 a.m.
Ponencia 2: Ecología microbiana tropical en la era genómica.
Gabriel Vargas. PhD y Adrián Pinto. PhD (Wisconsin- Madison
University- EEUU, Premio Nacional de Ciencia 2010). CIEMIC,
Universidad de Costa Rica.
10:00 - 10:30 a.m.
Receso para café.
10:30 - 11:15 a.m.
Ponencia 3: Monitoreo automático de vocalizaciones de la rana
Diasporus hylaeformis. Arturo Camacho PhD (University of
Florida, EEUU). Escuela de Ciencias de la Computación e
Informática, Universidad de Costa Rica.
11:15 - 12:00 p.m.
Conversatorio por sala.
Sala 2/ Mediterráneo BIOMEDICINA: Chairs: Dr. Rodrigo Mora y Dr. Alexandra Martínez.
8:30 - 9:15 a.m.
Ponencia 1: Análisis de beta lactamasas y su espectro frente
antibióticos betalactámicos, en bacterias multiresistentes.
Emiliano Barreto. PhD. Director del Centro de Bioinformática,
Instituto de Biotecnología - Universidad Nacional de Colombia.
9:15 - 10:00 a.m.
Ponencia 2: Towards a Complete Transcription Factor Binding
Site Map. Arnoldo Muller. PhD (Kyushu Institute of Technology,
Japan). simMachines. Costa Rica.
10:00 - 10:30 a.m.
Receso para café.
10:30 - 11:15 a.m.
Ponencia 3: Genotipos de interés en Plasmodium vivax y P.
falciparum: Resistencia a drogas, fallo diagnóstico y
candidatos a vacuna. Gustavo Fontecha. PhD (Universidad
Complutense de Madrid, España). Instituto de investigaciones
Microbiológicas. Universidad Autónoma de Honduras.
Miembro de la Red Centroamericana de Bioinformática y Biología
computacional.
11:15 - 12:00 p.m.
Conversatorio por sala.
--------------------------------------------------------------------------------------------------------12:00 – 1:00 p.m.
Almuerzo.
--------------------------------------------------------------------------------------------------------Salón AguaMarina
Tarde:
1:00- 1:45 p.m.
Plenaria tarde I (teleconferencia virtual): Fundación de
Supercomputación de Castilla y León: Una organización
apoyando los servicios en tecnologías industriales y científicas
en España. Carlos Redondo. PhD. Director General; Jesús
Lorenzana, Ruth Alonso. Fundación de Supercomputación de
Castilla y León (FSCL). España.
1:45- 2:30 p.m.
Plenaria tarde II: Presentación en plenaria. Bioinformática en la
nube como apoyo a la gestión de investigación: Cloud
Biocomputing, Web Services y Máquinas virtuales. Yuri Porras.
Gerente de Tecnologías. Microsoft de Costa Rica.
2:30 – 3:15 p.m.
Plenaria tarde III: Nanotecnología aplicada al campo de los
antibióticos. Juan Carlos Scoth. MSc (California State University,
EEUU), Coordinador técnico del área de Nanotecnología. Premio
Nacional de Tecnología 2010. Instituto Tecnológico de Costa Rica.
3:15 – 3:45 p.m.
Receso para café
3:45 – 4:30 p.m.
Plenaria tarde IV: Presentación en plenaria. Análisis
bioinformático de la coevolución molecular entre patógenos y
plantas. Alejandro Zamora. PhD (Cornell University, EEUU).
Escuela de Ciencias Agrarias. Universidad Nacional (UNA). Costa
Rica.
4:30 – 6:30 p.m.
Taller de Bioinformática I: Bioinformatics Introduction (Part
I). David Judge. PhD. Department of Genetics. Cambridge
University. England. Se entregará certificado de participación
validado por la Universidad de Cambridge. UK.
*** Se impartirá en inglés y se debe llevar computador personal.
----------------------------------------------------------------------------------------------------Actividad complementaria:
4:30 - 5:15 p.m.
Meeting projects (Bioinformática): Chair: Dr. Sergio Jiménez.
Maestría en Bioinformática y Biología de Sistemas. Universidad de
Costa Rica. Objetivo principal: Establecer posibles colaboraciones de
proyectos entre los expertos y participantes tanto nacionales como
internacionales. Salón Balí.
----------------------------------------------------------------------------------------------------Actividad opcional (libre exposición): Salón Mediterráneo
1:30 - 3:30 p.m.
Sala de poster en exhibición.
Presentaciones poster. (3 presentaciones) y project meeting
Poster categoría 1: Biomedicina y Medicina Molecular
Poster categoría 2: Biodiversidad y Biotecnología
Poster categoría 3: Medio Ambiente y Ecosistemas
----------------------------------------------------------------------------------------------------Viernes 30 de marzo:
Salón Rivera Velásquez
Mañana:
8:30 – 9:15 a.m.
Presentación en plenaria. Reconocimiento automático de
especies biológicas a través del sonido; redes neuronales y
machine learning. MSc. Arturo Castro. Outcoding Solutions /
Perkin Elmer Inc.
9:15 – 10:00 a.m.
Ponencia 1: “Identification of the role of deregulated
microRNAs in chronic lymphocytic leukemia” Valentina
Kovaleva. PhD. Universidad de Heidelberg, Alemania.
10:00 – 10:30 a.m.
Receso para café
10:30 – 11:15 a.m.
Presentación en plenaria. Infraestructuras computacionales
aplicadas a ciencias de la vida: Cluster Bioinformático “Nelly”.
MSc. Abel Brenes. Director del Centro de Informática.
Universidad de Costa Rica.
11:15 – 12:00 p.m.
Presentación en plenaria. BioDQ: Data quality Estimation and
Management for Genomics Databases. Alexandra Martínez. PhD
(University of Florida, EEUU). Escuela de Ciencias de la
computación (UCR). Profesora de la Maestría en Bioinformática y
Biología de Sistemas. Universidad de Costa Rica.
12:00 – 1:00 p.m.
Almuerzo
Tarde:
1:00 – 1:45 p.m.
Presentación en plenaria. Retos y confiabilidad de la ingeniería de
software en el ámbito científico: Una oportunidad
multidisciplinaria en Bioinformática? Ignacio Trejos Macaya.
PhD (Oxford University, UK), Rector de Cenfotec (Universidad
Tecnológica de Costa Rica); Escuela de Computación, Instituto
Tecnológico de Costa Rica (TEC).
1:45 – 2:30 p.m.
Presentación en plenaria. Redefiniendo la Biología: Biología
computacional y matemática. Tomás de Camino Beck. PhD
(University of Alberta, Canadá). Escuela de Biología, Universidad
de Costa Rica.
2:30 – 3:00 p.m.
Refrigerio
3:00 – 5:00 p.m.
Taller de Bioinformática II: Bioinformatics Introduction (Part
II). David Judge. PhD. Department of Genetics. Cambridge
University. England. Se entregará certificado de participación
validado por la Universidad de Cambridge. UK.
5:00 - 6:00 p.m.
Clausura.
---------------------------------------------------------------------------------------------------------Actividades complementarias:
3:00- 4:00 p.m.
Reunión de la Red Centroamericana de Bioinformática. Miembros
de la Red e invitados externos. Salón Balí.
------------------------------------------------------------------------------------------------------------
Sábado 1 de abril:
Transporte Hotel-Aeropuerto